Author(s):
Froufe, Hugo J.C. 
; Abreu, Rui M.V. ; Ferreira, Isabel C.F.R.
Date: 2012
Persistent ID: http://hdl.handle.net/10198/8188
Origin: Biblioteca Digital do IPB
Document details
Screening virtual e dinâmica molecular de compostos presentes em cogumelos com ...
Description
A família BCL2 é constituída por proteínas envolvidas tanto na apoptose como na sobrevivência da célula. Em alguns tipos de cancros, incluindo linfomas e cancros epiteliais, a sobreexpressão de proteínas anti-apoptóticas da família da BCL2, como é o caso da proteína BCL2, é indicativo de cancro em fase avançada, com mau prognóstico e resistente a quimioterapia [1]. Existem vários estudos que indicam que extratos de diferentes espécies de cogumelos têm a capacidade de promover o processo de apoptose em linhas celulares tumorais, mas o mecanismo de ação destes extratos é ainda desconhecido. Alguns compostos de pequena massa molecular (PMM), identificados em diferentes espécies, podem contribuir para as suas propriedades anti-tumorais e estar envolvidos na indução da apoptose [2]. Neste estudo, foi realizado um screening virtual de uma biblioteca de 40 desses compostos PMM, utilizando como proteína alvo a estrutura da BCL2 (PDB:2XA0). Como software de docking utilizou-se o AutoDock4 [3]. Os compostos que obtiveram energias de ligação mais baixas (<-10 kcal/mol) foram os seguintes derivados de esteróides: ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-ona, lactona lucidénica, cerevisterol e ácidos ganodéricos w e x. Realizaram-se também estudos de Dinâmica Molecular (MD) para estes 5 compostos usando o software Desmond v2.2 (D.E. Shaw Research, New York) e foram calculados os valores do desvio quadrático médio (RMSD) do composto e do recetor para cada simulação. Os RMSD dos 5 compostos, assim como o do recetor, estabilizaram após 1 ns, com a exceção do composto Ganoderic acid w que depois de parecer estabilizado a um RMSD médio de 1 Å aos 2.5 ns, estabiliza nos 2 Å. Os estudos de MD fornecem uma análise mais realista da interação proteína-ligando, desta forma o comportamento dos compostos é analisado em detalhe ao longo das simulações MD. Em conclusão, o processo de apoptose promovido por extratos de cogumelos pode estar relacionado com a inibição da BCL2, e de compostos esteróides como os aqui estudados. No entanto, são necessários mais estudos para comprovar esta hipótese.
A família BCL2 é constituída por proteínas envolvidas tanto na apoptose como na sobrevivência da célula. Em alguns tipos de cancros, incluindo linfomas e cancros epiteliais, a sobreexpressão de proteínas anti-apoptóticas da família da BCL2, como é o caso da proteína BCL2, é indicativo de cancro em fase avançada, com mau prognóstico e resistente a quimioterapia [1]. Existem vários estudos que indicam que extratos de diferentes espécies de cogumelos têm a capacidade de promover o processo de apoptose em linhas celulares tumorais, mas o mecanismo de ação destes extratos é ainda desconhecido. Alguns compostos de pequena massa molecular (PMM), identificados em diferentes espécies, podem contribuir para as suas propriedades anti-tumorais e estar envolvidos na indução da apoptose [2]. Neste estudo, foi realizado um screening virtual de uma biblioteca de 40 desses compostos PMM, utilizando como proteína alvo a estrutura da BCL2 (PDB:2XA0). Como software de docking utilizou-se o AutoDock4 [3]. Os compostos que obtiveram energias de ligação mais baixas (<-10 kcal/mol) foram os seguintes derivados de esteróides: ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-ona, lactona lucidénica, cerevisterol e ácidos ganodéricos w e x. Realizaram-se também estudos de Dinâmica Molecular (MD) para estes 5 compostos usando o software Desmond v2.2 (D.E. Shaw Research, New York) e foram calculados os valores do desvio quadrático médio (RMSD) do composto e do recetor para cada simulação. Os RMSD dos 5 compostos, assim como o do recetor, estabilizaram após 1 ns, com a exceção do composto Ganoderic acid w que depois de parecer estabilizado a um RMSD médio de 1 Å aos 2.5 ns, estabiliza nos 2 Å. Os estudos de MD fornecem uma análise mais realista da interação proteína-ligando, desta forma o comportamento dos compostos é analisado em detalhe ao longo das simulações MD. Em conclusão, o processo de apoptose promovido por extratos de cogumelos pode estar relacionado com a inibição da BCL2, e de compostos esteróides como os aqui estudados. No entanto, são necessários mais estudos para comprovar esta hipótese.
Document Type
Conference Object
Language Portuguese
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