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Predicting the secondary structure of proteins using Machine Learning algorithms

Rui Camacho; Rita Ferreira; Natacha Rosa; Vânia Guimarães; Nuno A. Fonseca; Vítor Santos Costa; Miguel de Sousa; Alexandre Magalhães

The functions of proteins in living organisms are related to their 3-D structure, which is known to be ultimately determined by their linear sequence of amino acids that together form these macromolecules. It is, therefore, of great importance to be able to understand and predict how the protein 3Dstructure arises from a particular linear sequence of amino acids. In this paper we report the application of Machi...


Convênios administrativos: uma proposta de releitura do seu regime jurídico à l...

Gustavo Alexandre Magalhaes

Os convênios administrativos (ou convênios de cooperação) constituem espécies de contratos administrativos, tendo por peculiaridade a inexistência de lucro para as partes. É necessário analisar de maneira distinta os regimes jurídicos dos convênios celebrados entre entes públicos (convênios públicos) e dos convênios celebrados entre a Administração e entidades privadas (convênios público-privados). No caso dos ...

Data: 2011   |   Origem: OASIS br

Amino Acid Pair- and Triplet-wise Groupings in the Interior of Alpha-Helical Se...

Miguel M de Sousa; Cristian R Munteanu; Alejandro Pazos; Nuno A Fonseca; Rui Camacho; Alexandre Magalhães

A statistical approach has been applied to analyse primary structure patterns at inner positions of α-helices in proteins. A systematic survey was carried out in a recent sample of non-redundant proteins selected from the Protein Data Bank, which were used to analyse α-helix structures for amino acid pairing patterns. Only residues more than three positions apart from both termini of the α-helix ...


Efficient aggregate computations in large-scale dense wireless sensor networks

Pereira, Nuno Alexandre Magalhães

Tese de doutoramento em Informática ; Assuming a world where we can be surrounded by hundreds or even thousands of inexpensive computing nodes densely deployed, each one with sensing and wireless communication capabilities, the problem of efficiently dealing with the enormous amount of information generated by those nodes emerges as a major challenge. The research in this dissertation addresses this challenge....


A study on amino acid pairing at the N- and C-termini of helical segments in pr...

Nuno A. Fonseca; Rui Camacho; Alexandre Magalhães

A systematic survey was carried out in an unbiased sample of 815 protein chains with a maximum of 20% homology selected from the Protein Data Bank, whose structures were solved at a resolution higher than 1.6 A ° and with a R-factor lower than 25%. A set of 5556 subsequences with a-helix or 310-helix motifs was extracted from the protein chains considered. Global and local propensities were then calculated for ...


AnÃlise genÃtico-histÃrica de haplÃtipos e haplogrupos do cromossomo Y humano n...

Alexandre MagalhÃes Martins

Neste trabalho foi feita a anÃlise dos polimorfismos de 15 microssatÃlites do cromossomo Y (haplÃtipo mÃnimo mais locos DYS447, DYS458, DYS464) em uma amostra da populaÃÃo de Pernambuco, constituÃda por 247 indivÃduos nÃo aparentados e um banco de dados construÃdos apartir de haplÃtipos das diversas populaÃÃes que historicamente participaram na composiÃÃo Ãtnica da populaÃÃo deste Estado. A abordagem estatÃstic...

Data: 2007   |   Origem: OASIS br

ANÁLISE DO COMPONENTE MANEJO FLORESTAL MADEIREIRO DO PROGRAMA ZONA FRANCA VERDE...

Alexandre Magalhães Pirani

Este projeto teve como objetivo avaliar as estratégias de implementação e os resultados obtidos, no período de janeiro de 2003 a abril de 2007, pelo componente manejo florestal madeireiro do Programa Zona Franca Verde (ZFV), do governo do Estado do Amazonas. O programa ZFV se compromete a contribuir para o desenvolvimento dos municípios do interior do Estado por meio de várias ações, entre elas o incentivo ao M...

Data: 2007   |   Origem: OASIS br

MUDANÇA ESTRATÉGICA, COMPORTAMENTO ESTRATÉGICO E FORMULAÇÃO DE ESTRATÉGIAS DE D...

Alexandre Magalhães

O estudo sobre mudança organizacional na adoção de estratégias tem crescido de importância tanto na academia como no meio empresarial. Isso ocorre, principalmente, devido ao acirramento da competitividade e das constantes mudanças do ambiente externo. Esta pesquisa teve como objetivo analisar as mudanças adotadas por uma pequena empresa de confecção na formulação de estratégias de diferenciação. Para isso, a pe...

Data: 2005   |   Origem: OASIS br

Sobre a origem psicossomática da moral na obra de Freud «Totem e Tabu»

Gama, Pedro Alexandre Magalhães de Saldanha da

O autor analisa as implicações psicossomáticas que decorrem da hipótese de Freud em Totem e Tabu.


A justiça militar no Brasil : estrutura e funções

Alexandre Magalhães Seixas

Essa dissertação analisa a Justiça Militar Federal, abordando temas acerca de sua importância para a sociedade, dentro do contexto do Poder Judiciário do Estado. Assim, serão estudadas a sua origem, evolução, estrutura, função e competência, bem como os efeitos de sua atuação dentro do Estado. Diante da envergadura da função precípua das Forças Armadas, interessa à sociedade civil e ao Estado de Direito dispor ...

Data: 2002   |   Origem: OASIS br

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