Author(s):
Pacheco, David João Gonçalves 
Date: 2009
Persistent ID: http://hdl.handle.net/10773/2148
Origin: RIA - Repositório Institucional da Universidade de Aveiro
Subject(s): Engenharia de computadores; Redes de computadores; Processamento distribuído; Computação; Divulgação científica
Description
A computação assumese
cada vez mais como um recurso essencial em
ciência, levando ao surgimento do termo eCiência
para designar a utilização
de tecnologias de computação avançada para suportar a realização de
experiências científicas, a preservação e partilha do conhecimento.
Uma das áreas de aplicação do conceito de eCiência
é o tratamento e análise
de imagens médicas. Os processos que lidam com imagem médica, tanto ao
nível clínico como de investigação, são exigentes em relação ao suporte
computacional, devido aos algoritmos de processamento de imagem que
requerem e à elevada capacidade de armazenamento relacionada com volume
das imagens geradas.
As políticas públicas e os avanços tecnológicos recentes orientados para a eCiência,
têm vindo a apoiar o desenvolvimento da computação em Grid, tanto
a nível dos middlewares como da instalação de capacidade de produção, como
um sistema de computação avançado que permite a partilha de recursos,
instrumentos científicos e boas práticas em comunidades virtuais.
Este trabalho tem como objectivo desenvolver uma estratégia e um protótipo
para o armazenamento de dados médicos na Grid, visando a sua utilização em
investigação. Uma preocupação diferenciadora prendese
com o objectivo de
colocar as potencialidades da Grid ao serviço de utilizadores não técnicos (e.g.
médicos, investigadores), que acedem a serviços de processamento e de
armazenamento e catalogação de dados de forma transparente, através de um
portal Web.
O protótipo desenvolvido permite a investigadores na área das neurociências,
sem conhecimentos específicos da tecnologia Grid, armazenar imagens e
analisálas
em Grids de produção existentes, baseadas no middleware gLite.
ABSTRACT: Computing has become an essential tool in modern science, leading to the
appearance of the term eScience
to designate the usage of advanced
computing technologies to support the execution of scientific experiments, and
the preservation and sharing of knowledge.
One of eScience
domain areas is the medical imaging analysis. The processes
that deal with medical images, both at clinical and investigation level, are very
demanding in terms of computational support, due to the analysis algorithms
that involve large volumes of generated images, requiring high storage
capabilities.
The recent public policies and technological advances are eScience
oriented,
and have been supporting the development of Grid computing, both at the
middleware level and at the installation of production capabilities in an
advanced computing system, that allows the sharing of resources, scientific
instrumentation and good practices among virtual communities.
The main objective of this work is to develop a strategy and a prototype to allow
the storage of medical data on the Grid, targeting a research environment. The
differentiating concern of this work is the ability to provide the nonexperts
users (e.g: doctors, researchers) access to the Grid services, like storage and
processing, through a friendly Web interface.
The developed prototype allows researchers in the field of neuroscience,
without any specific knowledge of Grid technology, to store images and analyse
them in production Grid infrastructures, based on the gLite middleware. Mestrado em Engenharia de Computadores e Telemática
Document Type
Master Thesis
Language
English
Advisor(s)
Fernandes, José Maria Amaral; Oliveira, Ilídio Fernando de Castro
