Statistical application for DNA microarray data analysis

• Author(s): Bellina Teixeira ; Joel Arrais ; José Luís Oliveira
• Date: 2013
• Origin: Electrónica e Telecomunicações
• Subject(s): DNA microarray; Microarray Information Database; bioinformatic; statistical application; DNA microarray; Microarray Information Database; bioinformatic; statistical application
• Document Type: Article
• Language: English

Description

DNA (deoxyribonucleic acid) microarrays are used to analyze the expression of thousands of genes within a sample at the same time. These experiments generate a lot of information that is necessary to be stored and processed with the aid of computerized means.Mind (Microarray Information Database) is a web application developed at the bioinformatics group of the University of Aveiro that addresses the storage and processing of microarray data.In this article the development of a DNA microarray dataanalysis module for Mind is described. Some methods andtools for microarray data analysis are presented, namelystatistical methods, some aspect of the module developmentare described and the final result is exposed. Os microarrays de ADN (ácido desoxirribonucleico) são usados para analisar a expressão de milhares de genes numa amostra ao mesmo tempo. Estas experiências geram muita informação que é preciso armazenar e processar com recurso a meios informáticos.Mind (Microarray Information Database) é uma aplicaçãoweb desenvolvida no grupo de bioinformática daUniversidade de Aveiro que aborda o armazenamento e oprocessamento de dados de microarrays.Neste artigo descreve-se o desenvolvimento de um módulode análise de dados de experiências de microarrays de ADNpara o Mind. Apresentam-se procedimentos e ferramentas de análise de dados, nomeadamente métodos estatísticos,descrevem-se aspectos próprios do desenvolvimento domódulo e o resultado final é exposto.