Autor(es):
Santos, Nadine Castelhano 
Data: 2013
Identificador Persistente: http://hdl.handle.net/1822/27896
Origem: RepositóriUM - Universidade do Minho
Assunto(s): Quorum sensing; Formação de biofilms; TRN; PPI; Integração; Cross-talking; Biofilm formation; Integration
Descrição
Dissertação de mestrado de Bionformática O estudo do fenómeno de cross-talking entre P. aeruginosa e C. albicans tem sido focado
essencialmente nos processos de quorum sensing e formação de biofilmes, identificando-se os
genes e proteínas envolvidas. Contudo, mesmo já existindo um grande conhecimento dos genes
e proteínas envolvidas, ainda existe uma lacuna na integração dos mesmos nas redes biológicas
dos respectivos microorganismos. O número e qualidade das redes biológicas existentes
(Transcriptional Regulatory Network - TRN and Protein-protein Interactions - PPI) para os
fenómenos chave tais como, quorum sensing, formação de biofilmes, resistência a antibióticos e
patogenecidade, não evidenciam a importância de alguns destes genes no fenómeno de crosstalking.
Esta tese apresenta-se como a primeira tentativa de colocar em evidência os genes e
proteínas envolvidos em cross-talking, associando-os aos parceiros de interacção nas respectivas
redes biológicas de cada microorganismo. Primeiramente, utilizou-se um processo de integração
de redes para os dois microrganismos, levando ao aumento do conhecimento geral sobre os
processos de patogenecidade dos dois microorganismos, e por fim os genes envolvidos em
cross-talking, identificados na literatura, foram evidenciados nestas redes integradas. Com esta
tese pretende-se dar algumas pistas sobre como é que estes genes de cross-talking estão
envolvidos em importantes processos biológicos e também de algum modo apontar novos
potenciais drug targets. The study of the cross-talking phenomenon between P. aeruginosa and C. albicans has been
focus on the processes of quorum sensing and biofilm formation, identifying the genes and
proteins involved in this relationship. Although, there is a present knowledge on the genes and
proteins involved, there is still a lack in the understanding on how these genes are integrated into
biological regulatory networks of the respective microorganisms. The number and quality of the
existing biological networks (i.e. Transcriptional Regulatory Network - TRN and Protein-protein
Interactions - PPI) for key phenomena, such as quorum sensing, biofilm formation, antibiotic
resistance and pathogenesis does not highlights the importance of some genes and proteins in
the cross-talking phenomenon. In this thesis, constitutes the first attempt to put in evidence the
genes involved in cross-talking, associating them to the interacting partners within the biological
networks of the two microorganisms. First, the two microorganisms passed through a process of
network integration, leading to an augmentation in the general knowledge on pathogenic
processes, and then over those networks the cross-talking genes identified in literature were
highlighted. With this thesis we expect to give some new perspectives on how these cross-talking
genes are interconnected to important biological processes of the two microorganisms and to
point some new potential drug targets.
Tipo de Documento
Dissertação de Mestrado
Idioma
Inglês
Orientador(es)
Lourenço, Anália; Pereira, M. O.
