Author(s):
Cordeiro, Rita Rego Jesus, 1980- 
Date: 2011
Persistent ID: http://hdl.handle.net/10451/4591
Origin: Repositório da Universidade de Lisboa
Subject(s): Microbiologia; Helicobacter pylori; Proteínas da membrana bacteriana externa; Antigénios; Teses de mestrado 2011
Description
Tese de mestrado, Microbiologia Clínica, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2011 Neste trabalho pretendeu-se estudar a diversidade genética e evolução dos genes
homC e homD, que codificam para OMPs de H. pylori, num painel de 189 estirpes
isoladas de doentes de origem geográfica diferente e com diversas gastropatologias.
Foram utilizadas as técnicas de PCR e sequenciação e ferramentas de
bioinformática. Posteriormente, pretendeu-se esclarecer o papel destes genes na
virulência de H. pylori, através de ensaios in vitro e avaliação da antigenicidade das
respectivas proteínas.
A reconstrução filogenética do gene homC revelou uma segregação geográfica,
com três grupos predominantes, Ocidental, Oriental/Ameríndio e Africano. Foram
identificadas oito variantes alélicas, com especificidade geográfica nos alelos mais
prevalentes. Os resultados sugerem que estas variantes podem estar envolvidas na
adaptação da bactéria ao hospedeiro e constituir marcadores da patologia gástrica e
da virulência da estirpe.
O gene homD mostrou menor diversidade genómica. No entanto, no terminal-N
das proteínas HomD foi observada uma zona variável de repetições de motivos de
KP (2-9 KP), tendo-se verificado uma correlação entre um menor número de
repetições de motivos KP ( 4 KP) e a UP e o maior número de repetições ( 7 KP) e
a gastrite. A análise in silico da proteína HomD mostrou que esta região de
repetições exibe um elevado índice de hidrofibicidade e antigenicidade e uma alta
probabilidade de exposição à superfície da bactéria. A corroborar estes resultados,
demonstrou-se que a proteína HomD é antigénica.
Os ensaios in vitro sugerem que o gene homC poderá estar envolvido na resposta
inflamatória de H. pylori.
Globalmente, os resultados obtidos neste estudo sugerem que o gene homC está
implicado na interacção entre H. pylori e o hospedeiro, contribuindo para a virulência
desta bactéria. O gene homD parece ser um importante antigénio de H. pylori, e
devido à sua elevada conservação a nível mundial, poderá constituir um novo alvo
vacinal ou terapêutico.
This work aimed to study the genetic diversity and evolution of homC and homD
genes, coding for H. pylori OMPs, in a panel of 189 strains isolated from patients
from different geographical origins and presenting different gastric diseases. PCR,
sequencing and bioinformatics analysis were used. Subsequently, to clarify the role
of these genes in H. pylori virulence, in vitro experiments and evaluation of the
proteins antigenicity were performed.
Phylogenetic reconstruction of homC gene revealed a geographic segregation,
with three predominant groups, Western, East Asian/Amerindian and African. Eight
allelic variants were identified, with geographic specificity regarding the most
prevalent alleles. The results suggest that these variants may be involved in bacteria
adaptation to the host and constitute markers of gastric pathology and of strain
virulence.
homD gene showed a lower genomic diversity. However, in the N-terminus of
HomD a region with a variable number of KP motifs repeats (2-9 KP) was observed,
with correlation between the lower number of KP motifs repeats ( 4 KP) and peptic
ulcer disease and the largest number of repeats ( 7 KP) and gastritis. In silico
analysis of HomD protein showed that this region exhibits a strong hidrophilicity and
antigenicity and a high probability of being exposed to the bacterial surface. In
support of these results, it was demonstrated that HomD protein is antigenic.
In vitro experiments suggest that homC gene may be involved in H. pylori
inflammatory response.
Overall, the results of this study suggest that homC gene is involved in the
interaction between H. pylori and the host, contributing to bacterial virulence. homD
gene appears to be an important H. pylori antigen, and because of its high global
conservation likely constitutes a new therapeutic or vaccine target.
Document Type
Master Thesis
Language
Portuguese
Advisor(s)
Oleastro, Mónica, 1972-; Ramirez, Mário, 1970-
