Author(s):
Alves, Mara Lisa Vieira 
Date: 2007
Persistent ID: http://hdl.handle.net/10451/1358
Origin: Repositório da Universidade de Lisboa
Subject(s): Biotecnologia; Olea europaea; Teses de mestrado
Document details
Caracterização e estrutura genéticas da cultivar de oliveira 'cobrançosa' e sua...
Description
Tese de mestrado, Biologia (Biologia Celular e Biotecnologia), 2007, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências A oliveira é uma das espécies cultivadas com maior importância cultural e económica na bacia do Mediterrâneo (Ribeiro 1991). A 'Cobrançosa' é uma cultivar Portuguesa com muita importância na região de Trás-os-Montes encontrando-se actualmente disseminada por 6 regiões de Denominação de Origem Protegida (MADRP 2007). De modo a garantir a qualidade do azeite e aumentar a sua produção, é necessário seleccionar e certificar as árvores desta cultivar. Foram utilizados 10 loci associados a microssatélites para caracterizar e avaliar a estrutura genética de seis populações de 'Cobrançosa' e sua relação com outras cultivares e com o zambujeiro. Os parâmetros de diversidade como a heterozigosidade esperada e observada foram calculados. Determinou-se a distância genética entre acessos de acordo com [1 − proporção de alelos partilhados] (Dps) (Bowcock et al. 1994). A matriz resultante foi utilizada para estabelecer as relações fenéticas entre os acessos e para avaliar a eventual estrutura genética entre as diferentes populações. Não se detectou diferenciação entre as seis populações de 'Cobrançosa' avaliadas. Nesta cultivar foram detectados em média 5.4 ± 1.7 alelos por locus, sendo que, em média, 2.6 ± 1.3 tinham uma frequência inferior a 5% que poderão ser úteis, se à sua presença estiverem associadas determinadas características de valor agronómico. O valor médio de diversidade genética foi de 0.511 ± 0.203 o que permite perspectivar um processo de melhoramento desta cultivar de modo a fazer face às exigências do mercado do azeite. Embora a maior parte das árvores da cultivar 'Cobrançosa' seja geneticamente muito semelhante, verificou-se que esta cultivar parece ter uma origem policlonal. Com este trabalho foi possível desenvolver padrões de microssatélites que permitem a identificação dos acessos da cultivar 'Cobrançosa' e inclusive a detecção de sete árvores que possivelmente estarão incorrectamente identificadas como pertencendo a essa cultivar Olive is one of the most economically important species in the Mediterranean Basin (Ribeiro 1991). 'Cobrançosa' is a Portuguese cultivar with great importance in Trás-os- Montes region and is currently being cultivated in all six regions of Protected Origin Denomination (MADRP 2007). To guarantee olive oil quality and to enhance its productivity it is necessary to select and certify the trees from this cultivar. In this study 10 microsatellite loci were used to characterize and evaluate the genetic structure of six populations of 'Cobrançosa' and its relationships with other cultivars and with its wild relatives, oleasters. Diversity parameters like expected and observed heterozygosity were calculated. The genetic distance between the accessions was calculated according to [1 − proportion of shared alleles] (Dps) (Bowcock et al. 1994). The resulting matrix was used to establish the phenetic relationships among accessions and to evaluate the partitioning of the genetic variance observed. No differentiation among the 'Cobrançosa' populations was detected. A mean of 5.4 ± 1.7 alleles per locus were detected of which 2.6 ± 1.3 had a frequency below 5%. These rare alleles can be useful if some attractive agronomic characteristics are associated to their presence. The mean value of genetic diversity was 0.511 ± 0.203 which allows for the establishment of an improvement program to face the demands of the olive oil industry. Although most of the 'Cobrançosa' accessions evaluated were genetically similar, it was demonstrated that this cultivar has indeed a polyclonal origin. With this work it was possible to develop microsatellite profiles to identify the accessions of the 'Cobrançosa' cultivar including the detection of trees that were incorrectly identified has belonging to this cultivar
Tese de mestrado, Biologia (Biologia Celular e Biotecnologia), 2007, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências A oliveira é uma das espécies cultivadas com maior importância cultural e económica na bacia do Mediterrâneo (Ribeiro 1991). A 'Cobrançosa' é uma cultivar Portuguesa com muita importância na região de Trás-os-Montes encontrando-se actualmente disseminada por 6 regiões de Denominação de Origem Protegida (MADRP 2007). De modo a garantir a qualidade do azeite e aumentar a sua produção, é necessário seleccionar e certificar as árvores desta cultivar. Foram utilizados 10 loci associados a microssatélites para caracterizar e avaliar a estrutura genética de seis populações de 'Cobrançosa' e sua relação com outras cultivares e com o zambujeiro. Os parâmetros de diversidade como a heterozigosidade esperada e observada foram calculados. Determinou-se a distância genética entre acessos de acordo com [1 − proporção de alelos partilhados] (Dps) (Bowcock et al. 1994). A matriz resultante foi utilizada para estabelecer as relações fenéticas entre os acessos e para avaliar a eventual estrutura genética entre as diferentes populações. Não se detectou diferenciação entre as seis populações de 'Cobrançosa' avaliadas. Nesta cultivar foram detectados em média 5.4 ± 1.7 alelos por locus, sendo que, em média, 2.6 ± 1.3 tinham uma frequência inferior a 5% que poderão ser úteis, se à sua presença estiverem associadas determinadas características de valor agronómico. O valor médio de diversidade genética foi de 0.511 ± 0.203 o que permite perspectivar um processo de melhoramento desta cultivar de modo a fazer face às exigências do mercado do azeite. Embora a maior parte das árvores da cultivar 'Cobrançosa' seja geneticamente muito semelhante, verificou-se que esta cultivar parece ter uma origem policlonal. Com este trabalho foi possível desenvolver padrões de microssatélites que permitem a identificação dos acessos da cultivar 'Cobrançosa' e inclusive a detecção de sete árvores que possivelmente estarão incorrectamente identificadas como pertencendo a essa cultivar Olive is one of the most economically important species in the Mediterranean Basin (Ribeiro 1991). 'Cobrançosa' is a Portuguese cultivar with great importance in Trás-os- Montes region and is currently being cultivated in all six regions of Protected Origin Denomination (MADRP 2007). To guarantee olive oil quality and to enhance its productivity it is necessary to select and certify the trees from this cultivar. In this study 10 microsatellite loci were used to characterize and evaluate the genetic structure of six populations of 'Cobrançosa' and its relationships with other cultivars and with its wild relatives, oleasters. Diversity parameters like expected and observed heterozygosity were calculated. The genetic distance between the accessions was calculated according to [1 − proportion of shared alleles] (Dps) (Bowcock et al. 1994). The resulting matrix was used to establish the phenetic relationships among accessions and to evaluate the partitioning of the genetic variance observed. No differentiation among the 'Cobrançosa' populations was detected. A mean of 5.4 ± 1.7 alleles per locus were detected of which 2.6 ± 1.3 had a frequency below 5%. These rare alleles can be useful if some attractive agronomic characteristics are associated to their presence. The mean value of genetic diversity was 0.511 ± 0.203 which allows for the establishment of an improvement program to face the demands of the olive oil industry. Although most of the 'Cobrançosa' accessions evaluated were genetically similar, it was demonstrated that this cultivar has indeed a polyclonal origin. With this work it was possible to develop microsatellite profiles to identify the accessions of the 'Cobrançosa' cultivar including the detection of trees that were incorrectly identified has belonging to this cultivar
Document Type
Master Thesis
Advisor(s) Fevereiro, Manuel Pedro Salema
Advisor(s) Fevereiro, Manuel Pedro Salema
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