Análise do padrão de metilação do carcinoma pavimento-celular da cavidade oral

• Autor(es): Domingues, Ana Beatriz Cainço
• Data: 2013
• Identificador Persistente: http://hdl.handle.net/10316/24690
• Origem: Estudo Geral - Universidade de Coimbra
• Assunto(s): Carcinoma pavimento-celular da cavidade oral (CPCCO); Mecanismos moleculares; Metilação de DNA; MS-MLPA
• Tipo de Documento: Dissertação de Mestrado
• Idioma: Português
• Orientador(es): Carreira, Isabel; Alpoim, Carmen

Descrição

Resumo O carcinoma pavimento-celular da cavidade oral (CPCCO) representa um grupo de neoplasias, de origem epitelial, localizadas em diversos locais anatómicos da cavidade oral. As taxas de incidência e mortalidade associadas a esta neoplasia são elevadas, especialmente nos países desenvolvidos. O CPCCO representa a nível mundial a décima neoplasia mais comum nos homens, sendo mais frequente em indivíduos do género masculino do que feminino (2:1). Nas últimas décadas foram realizados progressos consideráveis na terapêutica para esta neoplasia, contudo estes não foram acompanhados pelo aumento da sobrevida a 5 anos. Uma das principais razões para este facto reside na realização do diagnóstico tardio. Deste modo é necessário a investigação genética para a deteção da doença em estadios iniciais de desenvolvimento, através do estudo de potenciais biomarcadores associados ao cancro oral. O objetivo principal deste trabalho consiste no estudo das alterações genéticas e epigenéticas de 30 amostras de CPCCO através da técnica de MS-MLPA. Simultaneamente foi pretendido validar o material parafinizado para estudos retrospetivos. A análise por MS-MLPA demonstrou alteração no número de cópias e no perfil de metilação de 37 genes supressores tumorais, sendo as alterações mais frequentes encontradas nos genes WT1, GSTP1, BRCA1, GATA5, CDKN2A, PYCARD, PAX5, MLH3, MSH6, CASR e TP53. Os resultados obtidos na comparação entre as amostras de tecido fresco e parafinizado foram de forma geral satisfatórios. Em conclusão, este trabalho permitiu verificar algumas alterações moleculares concordantes com as alterações referidas na literatura como associadas ao CPCCO, assim como associar alterações em determinadas regiões cromossómicas ou genes com o desenvolvimento tumoral. Desta forma, este estudo contribui para a abordagem de potenciais biomarcadores com potencial valor para o diagnóstico e prognóstico. Contudo novos estudos devem ser realizados com um n amostral superior, de forma a estabelecer uma correlação entre as características clinicopatológicas e o genótipo, determinar com maior precisão os genes associados ao desenvolvimento e progressão do cancro oral, assim como aumentar a concordância entre as amostras de tecido fresco e parafinizado. Oral squamous cell carcinoma (OSCC) represents a group of epithelial origin cancer located at different anatomical sites of oral cavity. Oral cancer incidence and mortality rates are high worldwide, especially in developed countries. OSCC represents globally the tenth most common cancer in men and is more frequent in men than in women (2:1). In the last decades considerable progress has been made in the treatment for this disease, however this was not accompanied by increased survival beyond 5 years. One of the main reason for this discrepancy seems to be the late diagnosis. Therefore it is necessary the detection of the disease in early stages of development through the study of potential genetic biomarkers associated with oral cancer. The main goal of this work was the study of genetic and epigenetic alterations of 30 OSCC samples by MS-MLPA. The analysis of MS-MLPA showed changes in copy number and methylation profile of 37 tumor suppressor genes. Additionally was also intended to validate the formalinfixed paraffin-embedded (FFPE) tissue for retrospective studies. The most frequent alterations were found in WT1, GSTP1, BRCA1, GATA5, CDKN2A PYCARD, PAX5, MLH3, MSH6, CASR and TP53 genes. In conclusion, this work showed some molecular aberrations consistent with those already described in the literature as associated with OSCC, as well as the involvement of certain chromosomal regions or genes associated with tumor development. Thus, this study highlighted some putative new biomarkers with possible diagnostic and prognostic value. Futher studies enrolling a larger cohort are needed in order to validate these putative biomarkers as well as increase the agreement between fresh and FFPE samples. Dissertação de mestrado em Bioquímica, apresentada ao Departamento de Ciências da Terra da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra.